Недавно с UEFI восстанавливал в полуавтоматическом режиме, с установочного диска Debian Netinstall, единственно что надо было сделать вручную, так это подмонтировать системный раздел EFI в /boot/efi .
Естественно, если у вас загрузка через UEFI, то живой диск для восстановления надо запускать тоже в режиме UEFI.