Используется emacs 25.3.1 в gentoo.
Если собрать с поддержкой иксов (т.е. с флагом 'X'), то 'M-X' (а именно ALT-X) работает, и можно выполнить какую-нибудь команду.
А если собрать без 'X', emacs запустится в xterm, и ALT-X не будет работать. Вместо этого будет появляться сообщение:
ø is undefined
ESC-X работает во всех случаях.
Как заставить ALT работать?