ps aux от root-а точно покажет все процессы.

запускать долго выполняющиеся процессы с помощью nohup так себе затея. systemd unit (или аналог), ну в самом крайнем случае (если это не демон, а именно что-то долго исполняющееся) - screen/tmux.

Или благородный Дон что-то не договаривает,

или ожидает того, чего быть не должно.

Если брать, например, кластер МГУ Ломоносов - то это набор весьма независисых друг от друга машин, которые связаны быстрой сетью и на которых умеют автоматически запускаться MPI-процессы (если их запускать правильно, через torque - местный планировщик).

Если брагородный Дон запускает что-то на одном компе минуя планировщик, то а) он и не должен ничего видеть на остальных компах; б) чтобы посмотреть процессы на этих остальных компах, туда нужно было бы явно зайти по ssh (или выполнить там команду).

Но в том же Ломоносове на другие хосты минуя login-host попасть нельзя.

Или кластер - это бывает что-то другое?

Явный вход по ssh помогает, спасибо. Бывает и другое, бывает и Ломоносов..