Запустить приложение на одном ядре

Лучше озвучить цели, а не методы решения.
А пока можно начать с RTLinux.

Нужно запустить SCADA систему, на данный момент бывают редкие случаи, когда она подвисает на время, что не очень хорошо.

изучить cgroups в нем кажись все твои пожелания внедрены..

taskset должен помоч

Куда копать?

Совместный запуск Linux и baremetal OS: https://habr.com/ru/company/intel/blog/183576/

Очень врядли, что подвисает она из-за миграции планировщиком.
Ей достаточно выдать высокие cpu и io шары, а по ядрам пусть прыгает, как планировщик там решит.

Если речь идёт про микролаги, когда CPU загружен чем-то ещё, то cpu шарами cgroups это не решается, во всяком случае у меня не получилось.

Тогда возможно действительно нужно смотреть в сторону cgroups cpuset.

Ей достаточно выдать высокие cpu и io шары,

А конкретнее? Выставить приоритет -20?

Как пример конфигурации: cgroups, systemd и распределение процессора.

Сделать группу anyprocess и дать ей

group anyprocess {
  cpu {
      cpu.shares="1";
  }
  blkio {
      blkio.weight="1";
  }
}

group veryimportantprocess {
  cpu {
      cpu.shares="999";
  }
  blkio {
      blkio.weight="999";
  }
}

Это я понял, а как запихнуть все по, кроме нужного? Кокой самый правильный метод?

В том же посте по ссылке есть, например, такое решение:

Дальше cgrulesengd читает на старте /etc/cgrules.conf
Он с правами рута будет распихивать процессы по группам.