Занулить флеш накопитель

выкинуть - драйвер решил что флешу хана и ушел в ридонли, это one-way-ticket.
вариант2 - перепрошивать, тут уж как повезет.

Видимо это следствие удара.

Ладно, хрен с ней, она столько не стоит, чтобы её перепрошивать

kill it with fire

Чисто теоретически стоит проверить, не стоит ли движок на корпусе в положении «lock». Пару раз попадался, когда по случайности он был сдвинут.

Воспользуйся молотком.

А есть что-то для низкоуровневрй работы с SD/microSD картами под Онтопик?

Например для того чтобы изменить объем?

Полагаю, что нет, софт для ремонтников в основном для Windows. Ну или есть, но под очень ограниченный набор контроллеров.

что в dmesg

#!/bin/bash

SIZE=2000                      # 2K блоков (измените, по размеру карты)
BLOCKSIZE=1024                 # размер блока -- 1K (1024 байт)
DEVICE=/dev/usb_card           # устройство USB карты (измените, как надо)

dd if=/dev/zero of=$DEVICE count=$SIZE bs=$BLOCKSIZE

И будь что будет :)

Как затереть её?

Молотком