В gentoo переодически выкидывают старый софт, нет мантейнера нет ebuild'a. Если этот софт просто оставлять, то он тащит по зависимостям много чего и мешает обновляться. Поэтому его приходится удалять.
Как и во что (chroot/flatpack/snap и т.д.) лучше/проще упаковать такой бинарник, со всеми зависимостями, вплоть до libc? Чтобы меньше телодвижений.