Прошлый раз от этого грохнулся гном, но мне было пох, т.к. система была свежая и всё равно поставил kde.
Вроде должно хватить загрузиться в режиме восстановления и там из-под рута смувить файлы на соседний диск, а потом сменить точку монтирования /home. Но хватит ли этого, например, стиму (он фс не запоминает)?