Как сделать чтобы иксы загружались с повышенным приоритетом?

nice n=15 startx
?

Тогда уж только от рута:

nice -1 startx

Я крайне не советую этим баловаться.

А смысл?

Лучше поиграться с твоим wm и его силами назначать приоритеты различным приложениям. Или взять wm в котором это решается ;)

>Где можно этот приоритет прописать?

а зачем? мышка тормозит?