Хотелось, чтобы в каждой section номера формул и рисунков начинались заново. Я написал в преамбулу
\numberwithin{equation}{section}
\numberwithin{figure}{section}
Нумерация поменялась. НО! Ссылки на рисунки испортились и указывают хз куда. При сборке на все рисунки из 2ой section pdftex пишет следующее.
! pdfTeX warning (ext4): destination with the same identifier (name{figure.1}) has been already used, duplicate ignored <to be read again>
Прозреваю, что проблема известная и что надо ещё что-то со счётчиками сделать, но ничего не нашёл.