проблема с xfce4-panel

что могу предложить

[осторожно!не Ъ]

-выставить другой размер в пикселях

-обновить/пересобрать/переустановить/стереть кофиг, ибо у меня они автоматически уменьшаются, когда дело доходит до трея

Между «Меню Приложений» и «Регулятор громкости» тебе нужно поставить разделитель, в его настройках выбрать стиль «Transparent»