Опера с давних пор решила смотреть на GTK тему, но фигня получается, когда эта тема в нормальном формате (светлый текст/темный фон): во многих местах учитывается либо только цвет фона, либо только цвет текста.
Возможны любые костыли, например запрет доступа опере к каким-либо настройкам или программам (но каким?).
Решение:
GTK2_RC_FILES=~/.newgtkrc2 opera
