Настройка BIOS через ОС

Насколько помню, то нет. Часть информации можно из BIOS прочитать.

Ведь прошивка биоса из системы возможна (очень много прошивальщиков от производителей есть для оффтопиков). Те же часы записываются в CMOS. Почему нельзя настроить и остальное?

можешь скачать биос с сайта производителя
декомпилить его, внести изменения и снова скомпилить
затем прошить прямо из os
на моём hp так можно

Гигабайтовские матери так умеют. Те что с гибрид ефи, по крайней мере.

Напиши точную модель материнки и модель USB контроллера.

не работают PS/2 для клавиатуры и внутренний USB-контроллер

Возможно на материнке конденсаторы повзрывались, если не мост вообще. Пытаешься лечить следствие, странный ты.

биос это просто программа, всё что можно сделать из пользовательского меню настройки биос, можно сделать и из операционной системы, есть конечно нюансы... биос может некоторые устройства переводить в непрограммируемое состояние до перезагрузки.

Мне этот вопрос давно не дает покоя. Но нет, в общем случае нельзя

Для моей материнки (gigabyte) на диске поставлялась программа под венду, позволяющая прямо там изменять настройки BIOS. Работоспособность не проверял, т.к. венды под рукой нет, но подозреваю, что чисто технически это возможно.

По идее если найти идентичную материнскую плату, сделать на ней нужные настройки BIOS, сдампить CMOS в файл, а потом записать этот дамп в CMOS на проблемной материнской плате, то должно работать.

Это для десктопа, в ноутбуках может быть все хитрее.

В зависимости от производителя могут быть готовые утилиты.

Для серверов HP - conrep (работает в Linux и Windows). Сохраняет настройки BIOS в XML-файл, который можно потом отредактировать и раскатать на несколько серверов.

Можно не только в теории, но смотря что настраивать.
http://stanislavs.org/helppc/cmos_ram.html
И это будет работать только в однозадачной среде.