https://github.com/systemd/systemd/issues/5644
Для Ъ: в systemd есть механизм для очистки временных директорий, который, в том числе, может удалять файлы по маске. В маску «/tmp/.*» у systemd подпадает в том числе и «/tmp/..». Такие дела.
P.S. Да, я знаю, что эту проблему уже починили, но это не делает быдлокод менее эпичным.