Заметил, что при удалении определённых программ, некоторые файлы из /etc и /etc/init.d не удаляются. В итоге, при достаточно активном использовании gentoo, в /etc образуется помойка.
Был такой скрипт cruft, который частично решал эту проблему, но автор на него забил.
Может ещё какие скрипты есть?
p.s.
по-моему,только в debian'е с этим делом всё просто.