Вот с общесистемными конфигами всё понятно: всё в /etc, можно взять и забэкапить эту директорию.
А почему тогда юзерские конфиги хранятся прямо в $HOME, а не, скажем, в $HOME/.etc/ ?
Я вот захотел себе общий между разными системами $HOME, но с разными конфигами. Если б всё было в одном месте - я бы просто мог подмонтировать в эту директорию что-то отдельное или отделаться симлинками, а при том как оно есть - мне либо придется городить симлинки на каждый случай, либо вообще хз.