LINUX.ORG.RU

Сообщения silw

 

Запрещенная информация

Роскомнадзор родил:

Включению в «черный список» подлежат также сайты, на которых размещены предложения, просьбы или приказы совершить самоубийство, где самоубийство _одобряется или называется способом решить проблему_. Запрещаются и ресурсы, публикующие опросы и рейтинги лучших способов самоубийства, а также соответствующие практические рекомендации, либо высмеивающие неудачные попытки совершения суицида.

То есть классическое «Вдоль!» все?

silw
()

Контора по починке БП в ДС

В нашем замечательном институте «подтек» ноль, в результате 2 прогоревших насквозь сетевых фильтра, 3 БП, кондиционер и прочая мелочевка. В связи с чем встала насущная необходимость ремонта. Есть ли какие-нибудь годные конторы? (территориально лучше в какой-нибудь окрестности от м. Университет)

 ,

silw
()

Доработать MPI версию программы для моделирования ДНК

В ходе переписки с товарищами, которые разработали довольно интересную крупнозернистую (coarse-grained) модель ДНК для моделирования молекулярной динамики и Монте-Карло, выяснилось, что у них затык с доработкой MPI версии.

You are right. The MPI version is experimental, and at the moment does not run in parallel (which we agree would be the whole point). A decent MPI programmer (none of us is) should be able to make it work in very few steps, so we put it out with that hope.

А так как людям, в частности мне, бывает интересно работать с большими, даже с учетном cg, системами, параллельность нужна как воздух.

Проект oxDNA разрабатывается, преимущественно, группой физиков из Оксфорда. Написан на C++, лицензия GPLv3.

Исходники лежат по ссылке.

Тут постоянно люди ищут проекты для приложения собственных сил, возможно кто-то заинтересуется и сможет помочь.

Вознаграждения отсутствует, максимум - я могу угостить пивком при встрече в ДС или ДС2.

 ,

silw
()

Централизованное отключение

Участившиеся случаи отключения электричества (несколько раз вчера, из-за пожара на Биофаке МГУ, сегодня из-за ремонтных работ) настойчиво напоминают, что надо бы уже запитать от упса пользовательские компьютеры, а не только пару серверов. Проблема в том, что упс хоть и толстый, но один.

Вопрос - как осуществить централизованное отключение всех машин, при сигнале с сервера, к которому подключен упс с настроенным nut.

В голову пришел вариант, виденный, вероятно, когда-то на лоре: пользователь с авторизацией по ключу и /sbin/poweroff в качестве шелла, соответственно при падении заряда батерии, запускается скрипт с ssh на все машины из списка.

Еще придумался вариант с Linux-HA hearbeat сервером.

Существуют ли более адекватные варианты?

 ,

silw
()

Трэкбол

Реквестирую истории успеха по покупке и эксплуатации Kensington Orbit with Scroll ring или аналогов (с шаром по центру а не под большим пальцем). В случае наличия таковых, желательно написать, где приобретали.

В текущих условиях, в тех редких случаях, когда надо пользоваться мышкой, делать это не очень удобно по причине стесненного пространства. Тем более когда приходится рисовать что-то в инкспейпе/блендере.

 ,

silw
()

инструкция по применению

в местных тредах не раз озвучивалось, что девушки существа странные и непонятные, а кампутеры хорошие и послушные. утверждение, бесспорно, вопиющее 4.2.

хотя бы вот поэтому.
Ъ: по ссылке подробная блок схема по взаимодействию с девушкой в типичных ситуациях, сделанная ей самой в yEd под самостоятельно установленной xubuntu.

но, надо заметить, для подобного есть определенные предпосылки: она рисует вот такие картинки и варит борщ и носит футболки с xkcd.
Ъ: схема взаимодействия флюоресцентного белка с АТФ

то есть она просто адекватная умная девушка, со всеми полагающимися атрибутами. (и блондинистость ей ничуть не мешает).

считаю уместным, по этому поводу, обратиться к местным обитателям, утверждающим, что девушки не нужны:

Критерий Ройтберга: чем больше красивых девушек тусуется на научной конференции, тем успешнее развивается данная область науки.

Так что не нужны, пожалуй, тут вы.

 ,

silw
()

Опознать мелодию

Не оставляет чувство, что эта мелодия похожа на что-то чуть более известное.

для Ъ - недурная собой девушка поет что-то на английском.

 ,

silw
()

Небольшая программка на Java

Длительное время ковыряю задачку, перепробовал различные алгоритмы кластеризации, но результат не устраивает. Наткнулся на гибридный алгоритм DeLiClu, который сочетает иерархическую кластеризацию и по плотности. Реализация от авторов алгоритма написана на Java и входит в библиотеку ELKI. Все бы хорошо, можно было бы дернуть из питона через какую-нить обертку, но под мои нужды надо кое-что допилить, а с Java я не сталкивался.

Всей работы минут 10. От меня благодарности и, при физической возможности, пиво или прочие плюшки.

 , elki,

silw
()

Nvidia Quadro + Philips 3D TV + PyMol

Докупили в лабораторию телевизор для полезных нужд. Так сложилось, что телевизор Philips умеет 3D и в комплекте оказалась пара очков. Тут же возникло желание заставить эту штуку показывать 3D в программах для визуализации 3D структур биологических молекул, таких как PyMol или VMD.

Однако возникла небольшая проблема - из производительного видео, максимум что у нас есть Zotac 480 GTX. А для работы 3D в этом софте, если верить Нвидии, нужны карточки Quadro, так как только они поддерживают Quadro Buffered Stereo. Попытка натянуть на 480ю дрова от Quadro под оффтопиком при помощи модификации inf оказалась несколько бессмысленна - драйвер встал, но quadro там и не пахло. Soft-mode, как в гайде сделать с этой карточкой нельзя, RivaTuner не дает такой возможности, ибо не обновлялась с 2009.

Собственно вопрос - может ли кто-то протестировать описанный (или подобный) в названии темы сетап под он или офтопиком? Или дать не совсем древнюю quadro карточку c hdmi в ДС на пару дней для тестов.

Эксперимент нужен, чтобы понять, брать или нет такую карточку, ибо то, что нам подходит стоит от 30к - просто так выбрасывать такие деньги не хочется, особенно с учетом того, что считать лучше на GTX или Tesla.

 , ,

silw
()

Модификация RFID метки

Есть такая замечательная фирма Applied Biosystems, производящая лабораторное оборудование и расходники для него. Но вот проблема - как и все производители расходников они непрочь нажиться на потребителях, причем весьма неплохо. Ситуация, с которой столкнулись мои коллеги: есть полимер для секвенатора - POP-7. Он поставляется в капсулах с RFID меткой. При каждом запуске секвенатор отмечает количество прошедших пусков и в итоге возникает ситуация, когда капсула еще наполовину полная, а работать с ней секвенатор отказывается. Что при цене в пару десятков килорублей за капсулу не очень радует.

Суть вопроса: может ли кто-то из лоровцев попробовать считать/модифицировать данные с RFID метки. На самой метке читается Tag-it tm и 80M. Соответственно образец метки у меня есть. Фото капсулы с меткой: спереди,сзади.

Поощрение: благодарность научного сообщества и какое-то количество пива или другого алкоголя лично от меня.

Дополнительная информация: из док Applied Biosystems получить сколько-нибудь внятной информации об этих метках не удалось.

 

silw
()

посредник для Amazon

Возникло желание прикупить хороших полезных книжек с амазона. по физике, молекулярной биологии и прочему. годных, со свежим материалом, написанных хороших языком. но встала небольшая проблема: нужен посредник, который готов работать с юр. лицом, ибо деньги грантовые.

Есть ли истории успеха? Можете ли кого-то посоветовать?

Пробовал позвонить в пару контор, вроде bay.ru и ebaytoday.ru - только с физ. лицами.

 ,

silw
()

Состояние CUDA

Вчера начал играться с CUDA - собирал GROMACS с поддержкой CUDA через библиотеку OpenMM. отхватил немного головной боли, но в итоге работает на связке GCC-4.5 + CUDA Toolkit 4.1 + блоб Nvida 295.40 + OpenMM 4.1

Прирост получился интересный, на задачах определенного типа GTX480 делает corei5-2500 в 4 раза.

Вопрос: стоит ли пробовать собирать с CUDA Toolkit 4.2 ... 5.0? С какой версией GCC? Пробовать блоб 302.11? Есть истории успеха? Или уже известны регрессии?

Или «работает - не трожь» ?

cast Eddy_Em

 , ,

silw
()

Доклад про лицензии

Назрела необходимость сделать небольшой рассказ про важность лицензирования своих академических поделок, общий обзор доступных лицензий и выбора нужной. Часа на полтора (пара). Накидал примерный план. Что можно еще включить или на какие примеры сослаться? Возможно у кого-то есть уже какие-то подобные материалы или заготовки.

  • Вы написали код:
    • довольны собой и вам больше ничего не надо
    • хотите с кем-нибудь им поделиться
  • Если вы хотите поделиться:
    • концепция интеллектуальной собственности, авторского права (личные неимущественные и имущественные права)
      применительно к миру в целом особенности для РФ
    • патенты на ПО и алгоритмы в мире и РФ, примеры патентных войн (Microsoft vs Google (Android), Apple vs Everyone)
  • Вы таки точно решили поделиться, на каких условиях вы хотите это делать?(=лицензия)
    • вам ничего не надо: WTFPL,BSD*
    • у вас есть условия: Apache, GPL*, Mozilla, MIT(X11)
      «вирусность» GPL
    • кастомные лицензии (комбинации BSD и GPL и т.д.)
    • EULA
      отметить про AS IS, отказ от любой ответсвенности и гарантий
  • Вы не программист, а художник, музыкант или другой «креативный» субъект
    • Creative Commons
    • WIkipedia, Jamendo, OpenCliaprt и т.д.
  • Организации, занимающиеся популяризацией и поддержкой: FSF, Wikimedia, Creative Commons, различны опенсорц консорциумы
    На примере GPL violations

 

silw
()

html2pdf

Есть пачка html в utf8 и русскоязычным текстом. Надо это превратить в pdf.

Проблема: и htmldoc, и python-pisa выдают кракозябры для всего, что отлично от латиницы.

Какие есть альтернативные варианты? Или починить упомянутые.

 ,

silw
()

Каким должен быть семейный компьютер?

Синопсис:

Домашний компьютер уже давно превратился из дорогой игрушки в насущную необходимость, причем как для родителей, так и для их детей. С какого возраста сажать ребенка за компьютер? Как выбрать компьютер, который удовлетворял бы запросы всех членов семьи? На эти и другие вопросы читателей «Ленты.ру» ответит руководитель отдела по продвижению операционных систем Microsoft в России Мария Мелкова.

Источник

Для задания вопроса нужен только e-mail, 10minutemail и прочие подобные подойдут...

Пир начнется:

Ориентировочная дата публикации ответов - 19 апреля.

 ,

silw
()

Новый виток - CISPA

Under the Cyber Intelligence Sharing and Protection Act (CISPA), if a cyber threat is even suspected, companies we use to access the Internet will have the right to collect information on our activities, share that with the government, refuse to notify us that we are being watched and then use a blanket immunity clause to protect themselves from being sued for violation of privacy or any other illegal action.

Ъ: новый законодательный акт в США, который дает Большому Брату еще больше возможностей для скрытой слежки за деятельностью пользователей интернетов.

 ,

silw
()

Лента.ру таки торт

Они ищут рубистов, но самая вкусняшка в требованиях

  • Собственно уметь программировать на ruby. Хорошо, если за плечами есть опыт программирования на других server-side скриптовых языках, например perl.
  • Из полезных фреймворков и утилит надо знать Ruby on Rails с его многообразным багажником гемов.
  • В качестве основной базы данных мы продолжаем использовать MySQL, благо нам пока хватает. В качестве быстрого помощника Redis.
  • Основным веб сервером нам служит nginx, но apache мы ещё используем. Мало знать как они конфигурируются. Понимать принцип их работы - очень важно.
  • Для работы в команде нам помогает git. Вам он тоже поможет.
  • Серверное окружение крутится на Linux Gentoo. «Слышал о linux» не подходит.
  • Помимо своего профиля необходимо четко представлять, чем занимаются коллеги по цеху. Поэтому html/js/css код вас не должен пугать. Вас не заставят что-то верстать, да и не дадут, но знать «как это делается» - надо. Так же как и вспомогательные утилиты, а-ля haml/sass.

вилку, как водится, не пишут.

 ,

silw
()

Трекер: баг или фича?

Старый трекер это баг или фича?
Если фича, то большое спасибо. Но название раздела дублируется (после ника ТС).
Если баг, то печально.

silw
()

[старье]Нужен кабель/переходник с 13W3 на VGA(D-SUB)

Есть SGI Octane, который надо бы вернуть к жизни.

С отсутствием SCSI сидюка я уже смирился и решил заливать ОС по tftp, но вот неожиданно встала проблема отсутствия возможности подключения монитора.

Хотелось бы сменять на пиво или прочую мелкую валюту. В ДС.

P.S. распиновку нашел, но сам разъем 13W3 тоже придется где-то покупать. так что хотелось бы избавиться от лишних поездок и геморроя.

silw
()

Подобрать NAS

Есть задача собрать NAS, бюджет до 200к.

Основной объем данных - бинарные файлы объемом от 20 до 40Гб, которые надо раздавать по NFS(?) на 7-8 линуксовых клиентов по 1Gb сети. Одновременно, скорее всего, будут работать 2-3 клиента на чтение и запись. Возможен перенос нескольких простеньких веб-сервисов на питоне и перле.

То, что я прикинул:
Корпус Supermicro CSE-826TQ-R800LPB 27к
Материнская плата Supermicro X8DTL-iF (2xSocket 1366, 2x1Gb LAN, 6xDDR3) 11,5к
Процессор Intel Xeon E5630 Gulftown (2533MHz, LGA1366, L3 12288Kb) 18к
Память Kingston KVR1333D3D8R9S/4G 3х4GB 6к
RAID контроллер Intel Original RS2WC080 x2 (1 Резерв) 20к
Жесткие диски для системы Western Digital WD1500HLFS (150GB, 10k) x2 (RAID 1 на встроенном в мать контроллере) 10к
Жесткие диски для хранилища WD2003FYYS (2TB, 7200) x11 (8 RAID5 XFS, 1 Backup, 2 Резерв) 104,5к
ИБП уже лежит что-то от APC, расчитанное на 700 или 800 Ватт.

Итого: 197к

В перспективе, возможен перенос некоторых операции по анализу данных на эту же машину, соответственно докупка еще одного процессора и 3х планок оперативки.

Возможно ли как-то оптимизировать этот набор? Или есть аналогичные готовые решения, укладывающиеся в эти цены?

silw
()

RSS подписка на новые темы