Уже давно не работал с апачем, а тут клиент попросил поставить именно эту связку. Поставил убунту 16.04 и для експеремента одни и те же скрипты выполнял на nginx php-fpm через юникс сокет и apache mod_fcgid и оказалось, скрипты выполняются в два раза быстрее на апаче.
Конфиг mod_fcgid
FcgidMinProcessesPerClass 1
FcgidMaxProcesses 20
FcgidIdleTimeout 3
FcgidProcessLifeTime 60
FcgidIdleScanInterval 0
FcgidErrorScanInterval 0
FcgidZombieScanInterval 0
FcgidSpawnScoreUpLimit 7000
FcgidSpawnScore 1
FcgidTerminationScore -1
FcgidTimeScore 3
Конфиг php_fpm
pm = dynamic
pm.max_children = 50
pm.start_servers = 10