Иногда, сами по себе, как то рэндомно, бывает раз в месяц, бывает раз в 4 месяца, некоторые процессы(nginx, php-fpm) переходят в nice = 1. Что может быть, кто их заставляет понижать свой приоритет?
Например, сегодня был переход в nice=1 php-fpm после возросшего iowait(делался бэкап). Может как то с этим связано?