Пока стоит в кроне ежедневный запуск badblocks, в случае обнаружения - отсылка в лог, вот только насколько плохо дергать каждый день винт и усиленно им шуршать на протяжении часа-двух? Может, стоит сократить до двух или одного раза в неделю?
Винты IDE/SATA, возраст 1-3 года.