Именно так: уже загруженные торренты показывает, а вот стоит добавить новое(или в уже загруженных добавить к загрузке то, что раньше не выбрал) так запись исчезает. Загрузка при этом идет и когда торрент загружен всплывает уведомление и он снова появляется в списке. Началось около месяца назад.
Debian jessie, qbittorrent 3.1.10