Alt нажми.

Может глобал меню стоит?

Не удержался

Не нужно (с)

Так и оказалось. Убрал его. Теперь меню появилось во всех приложениях за исключением libreoffice. Пробовал удалить пакет lo-menubar, но у меня его нет.

галку «решено» ставь