Есть демон, в нем включен DBus (DBUS_BUS_SESSION), отказывается запускаться из под root-а. пишет «Did not receive a reply. Possible causes include: the remote application did not send a reply, the message bus security policy blocked the reply, the reply timeout expired, or the network connection was broken.» Но, c другого пользователя запускается нормально. Возможно нужны особые правила для DBus. Поискал, прямого ответа не нашел.
Root нужен чтобы иметь полный контроль над системой.