Создал локальный репозиторий, как в вике по примеру.
eix видит репозиторий, emerge устанавливает пакеты, а вот профиля не видит до тех пор пока не прописал вот это: PORTDIR_OVERLAY="/usr/local/portage ${PORTDIR_OVERLAY}"
в make.conf.
Так и должно быть?