vmware и загрузка с физического жёсткого диска

Ты полностью подклчил жесткий диск в vmware или только партицию где линукс стоит ? во втором случае - соотв. порядок партиций другой ...

полностью, там только линукс и стоит

А у VmWare случайно диски не к SCSI адаптеру прицепились ? А то любит оно эмулировать SCSI а не IDE :)

да, и правда к scsi, но я подключаю жёсткий диск к ноутбуку через провод который в usb вставляется, и диск появляется sda и vmware его наверно scsi считает ,а он на самом деле ide ,вот как такое побороть ?

При загрузке реальной и в vmware корневая фс естественно должна быть одним и тем же устройством ну например /dev/sda1 иначе понятно загрузчик не находит /. Или загружаться с дискеты или cd и передавать параметр root=/dev/...