>> Насколько, примерно, увеличится производительность системы при перекомпияции ядра с i386 под i486(AMD5x86-133)
Я думаю, процентов на 10 максимум повысится скорость работы ядра. Про систему вцелом говорить сложно - все зависит от того, как ты ее используешь.

>> На сколько увеличится быстрота работы системы, если перекомпилировать приложения под i486?
Та же фигня, только применительно к софту.

>> Стоит ли делать одно без другого с точки зрения производительности системы?
Однозначно - перекомпилировать ядро стоит, это не занимает много времени, в отличии от перекомпиляции софта.

Как я ее использую

Слушаю музыку при помощи mpg123, работаю с GIMP и Netscape, в принципе это все. Работаю по X-ами в IceWm, брожу по Инету как dial-up'щик. То есть , наверное ясно почему я заговорил о производительности ;).