gnuplot как подписать графики?

если ты имеешь в виду автоматический поиск пустого пространства для надписей, то никак. либо пиши прогу которая делает это и вставляет в сценарии *.gp подписи, система координат firs/second, если тебе надо привязываться к графику, graph - если к рисунку в целом.

но для красивой статьи, пмсм, это не прокатит.

plot 'a.dat' using 1:2:3 with labels offset 1.0,-0.1

метки идут 3-м столбцом (4, если трехмерный график), значения смещения подбирать по вкусу.

И вообще, почитай уже наконец документацию и примеры на сайте! Достал свою леность мысли сюда вываливать.

Мне не надо данные подписывать. Мне надо графики подписать. Причём не просто циферку поставить, а провести от циферки до графика прямую. Да так, чтобы было понятно, к какому конкретно графику циферка относится, т. к. местами графики сливаются.

Пока оптимальное, что удалось придумать выглядит так:

set label 1 "1" at character 31, 17
set arrow 1 from 0.1, 1.03 to character 30, 16 nohead linetype -1 linewidth 1

character - чтобы не сильно много менять, если потребуют шрифт поменять.

Вот если бы у with labels offset был ключ, проводящий линию от точки до цифры....