Заметил, что когда длительное время работает firefox и eclipse при работе с firefox иксы начинают кушать 40% cpu, и в целом(не при работе с firefox'ом(но он остается включенным)) работа системы замедляется. Нашел временное решение: закрыть eclipse и firefox, за тем запустить их снова(если закрыть только оно из приложений, то эффекта не будет), но через час активной работы в этих приложениях тормоза опять появляются.
firefox
eclipse самый последний, стабильный