Установка Manjaro на 2 NVMe

Как установить систему и подкачку на первый диск, а на второй раздел Home?

Выбери для первого диска точку монтирования /, а для второго - /home

И какую файловую систему лучше использовать при этом? Btrfs или f2fs?

Ext4

Что за 20 век, разделы какие-то? Натяни на оба btrfs raid0 и настрой бэкапы.

Красноглазие нужно не всем

Ext4 Разве она не медленнее работает на ssd?

Нет. Даже если отстаёт от f2fs на N процентов - с nvme ssd ты этого просто не заметишь. Вряд ли это стоит красноглазия с сомнительной немейнстримной поделкой.

Btrfs вообще не быстрее ext4, её стоит использовать, если тебе нужны снапшоты и прочие фичи.

Забудь про f2fs для современных ssd, используй либо btrfs, либо ext4. Как по мне, btrfs нужна, если тебе нужны ее фичи, а судя по твоему вопросу оно не нужно. Я на nvme ssd использую ext4 уже давно, все устраивает.

UPDATE В итоге система неработоспособна на проприетарных дровах Nvidia. Не грузятся модули ядра. Но все равно спасибо за совет.