Как объеденить две аудиодорожки в видео в одну?

Лень читать man ffmpeg, так что почитай за меня.

Можно и man mencoder почитать.

Не надо ничего читать — avidemux.

Хмм.. я был бы рад, если бы вы сказали как называется эта опция, не нашел что-то

Какая опция ещё? Там же в меню есть, потыкай.
Или вообще pitivi какой поставь, там нагляднее.

Я нашел опцию для выбора основной дорожки, а объединение двух дорожек в одну нету.

Тогда маны читай, чё.
Если соображалка не работает :)

Типичный ответ типичного линуксоида.

Как вариант - сначала свести дорожки в Audacity, затем добавить её в видео Avidemux'ом.

Если тебе надо сводить каналы, то в случае с mencoder-ом читай про -vf pan