The standard exFAT implementation is not journaled and only uses a single file allocation table and free space map. FAT file systems instead used alternating tables, as this allowed recovery of the file system if the media was ejected during a write (which occurs frequently in practice with removable media).
Ещё раз: single file allocation table and free space map.
Т.е. если вы случайно записали буквально ничего в начало партиции, exfat больше нет. Все данные о файлах потеряны.
В моём случае на флешку размером в 64GB было записано всего 3MB в начало партиции (не я - программа одна идиотская) - все данные навернулись. К счастью, ничего важного там не было.