Решил побыть труЪ, сделал такой эксперимент.
Создал каноничнейшее Java EE 6 Enterprise Application, задеплоил на каноничный Glassfish 3.1. Внутри Web Application со стартовой страничкой и оранжевой кнопочкой Java Web Start, также Stateless EJB модуль, доступ к которому получает Swing Java EE Application Client доставляемый на клиентскую машину с помощью Java Web Start. При нажатии на кнопочку вызывается EJB и результат пишется в Label. Все делалось нексколькими кликами, Glassfish взял деплоймент на себя.
Запустил, все работает прекрасненько. А теперь внимание
<fat-mode>
http://fotohost.jampo.com.ua/images/6f968b62fbcb6056733de30ca92225c0.png
</fat-mode>
Мда )