SI_Browser 1.0: просмотрщик картинок для врачей

не думаю что лор читают врачи, но программа похоже уникальная

Глупый вопрос, зачем врачам свой формат?

Этот формат содержит дополнительну информацио о пациенте и оборудовании, на котором картинку получили. Кроме того один файл может хранить несколько серий по несколько картинок. Например несколко сканирования на томографе, каждое из которых состоит из некоторого количества поперечных срезов - картинок. И помимо хранения стандарт DICOM включает в себя пересылку по сети, хранение, поиск, печать, передачу на носителях и т.д. Это позволяет единообразно обрабатывать информацию с различного оборудования различных производителей.

Не спрашивайте меня, откуда берутся закрытые форматы, и я не скажу вам, как всё абсурдно в этом мире... А вот у меня другой вопрос: какой вообще смысл в бесплатной, но закрытой программе? Опасение форка? Или может, для разбора формата она использует какую-нибудь покупную библиотеку, которая запрещает открывать исходники? В принципе, можно считать нормальной стратегию, когда программа завоёвывает популярность, а потом уже исходники открываются. Тогда проект можно форкать, сколько угодно - смысл это имеет только в том случае, если производный продукт СИЛЬНО переплюнет оригинал по функционалу. MPlayer вон тоже форкали, и где теперь тот MPlayerX?.. (Не сочтите за наезд...)

Т.е., это УЗИ, стоматология и прочее? Тогда это громадный линукса в медецину. Если имеем полноценную\наработки полноценной программы для медецинских учреждений - то это просто-напросто офигеть. Вендекапец в некоторых отделениях уже может произойти.

В любом случае, наличие такой программы - это хорошо.

"нна" <-- поправьте, что бы не имелось ввиду

Насколько я понял из объяснений КиберГуся, пока речь идёт только о просмотре уже сформированной картинки. Было бы замечательно появление программы, которая непосредственно работала с томографами и эти картинки получала...

Но и сделанный первый шаг - уже гуд.

чувствуете как бывшие делфисты-шароварщики начинают срать вам в мозги?
нужно срочно реверсить формат, и добавлять его поддержку в gqview и thumb и вообще в imagemagic
какого чёрта закрытый формат вообще имеет место быть

> "нна" <-- поправьте, что бы не имелось ввиду

fixed

Закрытый формат в области медицины - это серьезное преступление. Куда смотрят законодатели и право-охранители? Лихие 90-е давно прошли, пора!

Не волнуйся, в России используются открытые форматы - ручка и бумажка.

> fMad * (*) (28.09.2008 11:25:53)

> чувствуете как бывшие делфисты-шароварщики начинают срать вам в мозги?

Фанатизм вреден. "Чем вы занимались до 17-го (вариант: 91-го) года?"...

> нужно срочно реверсить формат, и добавлять его поддержку в gqview и thumb и вообще в imagemagic

Не возражаю. Вперёд и с песней. Вот даже материал есть:

http://www.ctmed.ru/DICOM_HL7/

К сожалению, в неправославном DOC-овом виде, ну да Бог с ним.

> какого чёрта закрытый формат вообще имеет место быть

Таки выясняется, что он вполне себе открытый.

> нужно срочно реверсить формат, и добавлять его поддержку в gqview и thumb и вообще в imagemagic

Кстати, мысль безусловно благая, но что-то мне подсказывает, что если б не обсуждаемая программа, fMad фиг бы узнал о существовании формата DICOM.

Кончайте меня смешить. Нету поддержки dicom в imagemagick? Их есть там! (Правда меня её "прямость" немного смутила)
Все так кричат и радуются будто это первый просмотрщик dicom для linux. Проследуйте в гугл, уважаемые.

Надо отметить что куча программ под linux умеет dicom, но не умеет метатэги его и не умеет его яркость выбирать (а dicom может быть с очень широким диапазоном) в итоге после конвертирования или на экране получаются серенькие картинки без дополнительной инфы которая была в dicom.

> ...медецину...

к логопеду, быдло!

> Кончайте меня смешить. Нету поддержки dicom в imagemagick? Их есть там!

> Все так кричат и радуются будто это первый просмотрщик dicom для linux.

Ну я просто привык по умолчанию людям доверять.

> (Правда меня её "прямость" немного смутила)

А что там не так с прямостью? Вообще, насколько я понял, основная проблема DICOM - это его контейнерность, так же, как и у TIFF: генераторы DICOM-изображений могут использовать свои алгоритмы сжатия, о которых парсер не подозревает:

http://www.ctmed.ru/DICOM_HL7/dicom/dicom_st.html

см. предпоследний абзац. Тем не менее, на этом основании никто, кажется, не говорит, что TIFF плохой...

> Надо отметить что куча программ под linux умеет dicom, но не умеет метатэги его и не умеет его яркость выбирать

А, Вы уже ответили на мой вопрос. Тогда остаётся выяснить, как с этим в новой программе.

ОпенПаскаль... закрытая программа... Закапывайте!

http://en.wikipedia.org/wiki/Dicom#External_links — по ссылкам есть ОГРОМНОЕ количество софта для работы с DICOM, в том числе и свободного.

Зачем... Её вполне можно раскопать в сорс ;)

> А вот у меня другой вопрос: какой вообще смысл в бесплатной, но закрытой программе?

Как какой? Хочет врач рентген пациента посмотреть - а ему сначала покажут рекламу новых скальпелей или инновационного чистого спирта.

Ну и паника, что в CIA могут посмотреть фотки твоих легких сильно пропиарит продукт.

Ух! Еще пяток лет и может быть линукс преодолеет отметку в 4% рынка.

DICOM - это НЕ закрытый формат, его описание свободно лежит на сайте NEMA (http://medical.nema.org/dicom/2007/)

Однако, если программа хочет рекламировать то, что читает DICOM, то она должна быть сертефицирована.

Что является вполне здравой мыслью.

В Debian достаточно поставить пакет med-imaging и всё нужное будет установленно.

Программу одобряю, хотя она далеко не первая.

DICOM нифига не закрытый формат, так что часть народа тут просто произвела метан.

Врачам особо не надо ЛОР читать, но в медицине, как впрочем и в других областях, тоже есть IT специалисты.

> Однако, если программа хочет рекламировать то, что читает DICOM, то она должна быть сертефицирована.

Метан. Никому она ничего не должна. Это !просмотрщик! DICOMа и не более того. Ни один врач в здравом уме не будет использовать ее для диагностики. Для диагностики надо как минимум соответствующее оборудование - откалиброваный монитор с 10-14 бит на серый цвет. Скажем так, что эта программа больше предназначена для медицинских ITишников, нежели для врачей.

она ролики умеет?
сам писал когда-то такую поделку

>откалиброваный монитор с 10-14 бит на серый цвет

метанируй дальше - еще скажи что человеческий глаз способен различить безграничное число оттенков серого, и нужно 128 бит на серый цвет

>>не думаю что лор читают врачи, но программа похоже уникальная

гыгы.

просматривать и KSquirrel может. Специализированный на PACS/DICOM просмотрщик тоже есть - http://www.linux.org.ru/view-message.jsp?msgid=2658415

>>чувствуете как бывшие делфисты-шароварщики начинают срать вам в мозги?
>>нужно срочно реверсить формат, и добавлять его поддержку в gqview и thumb и вообще в imagemagic

гыгы :)

а это что - http://ksquirrel.sourceforge.net/IMG/16200-dicom.png

и это - 

$ apt-cache show libmdc2
Package: libmdc2
Priority: optional
Section: universe/libs
Installed-Size: 648
Maintainer: Ubuntu MOTU Developers <ubuntu-motu@lists.ubuntu.com>
Original-Maintainer: Roland Marcus Rutschmann <rudi@debian.org>
Architecture: i386
Source: xmedcon
Version: 0.9.9.6-1ubuntu1
Replaces: libmdc
Depends: libc6 (>= 2.6-1), libglib1.2 (>= 1.2.0), libniftiio0, libpng12-0 (>= 1.2.13-4), zlib1g (>= 1:1.2.3.3.dfsg-1)
Conflicts: libmdc
Filename: pool/universe/x/xmedcon/libmdc2_0.9.9.6-1ubuntu1_i386.deb
Size: 252602
MD5sum: dc3aba326f377232c7b2b56e0d7d977d
SHA1: 31cb2d3e6fa1a819f3c044575ad91f8aa8dfdbb2
SHA256: 516840f513dc834ea5530cc9cfe687f7c496d3eef25c7613fcb33026a136eb21
Description: Medical Image (DICOM, ECAT, ...) conversion tool
 This project stands for Medical Image Conversion. Released under the
 (L)GPL, it comes with the full C-source code of the library, a
 flexible command line utility and a neat graphical front-end using
 the Gtk+ toolkit. The currently supported formats are: Acr/Nema 2.0,
 Analyze (SPM), DICOM 3.0, InterFile 3.3 and PNG.
 .
 This is the central library needed by medcon, xmedcon and derived
 programs
 .
 Homepage: http://xmedcon.sourceforge.net/
Bugs: mailto:ubuntu-users@lists.ubuntu.com
Origin: Ubuntu

курите Нему:

http://medical.nema.org/

Барко - один из лидеров диагностических дисплейных систем, продукцией Барко комплектуют свое оборудование Agfa, Siemens, Rafaello и многие другие бренды. Итак, специально для тебя, как наилучшего производителя метана в этом топике, цитирую с сайта http://www.barco.com/medical/en/products/product_specs.asp?element=2886&l...

Coronis 2MP (MDCG-2121-CB) 2 MegaPixel premium diagnostic grayscale display system - это самая дешевая диагностическая дисплейная система

Technology SA-SFT AM LCD IPS technology Active screen diagonal 540 mm (21.3") Active screen width 432 mm (17.0") Active screen height 324 mm (12.8") Pixel pitch 0.270 mm (0.01063") Resolution 1600x1200 / 1200x1600 Luminance 900 cd/m² (262.68 fL) (typ) DICOM calibrated luminance (native white) 500 cd/m² (145.93 fL) Contrast ratio 700:1 (typ) Viewing angle 170° Look up table 12 bit ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

Подчеркнутое, дорогой метанатор, обозначает что дисплейная система (видеодаптер+монитор) отображает 12-ти битный серый цвет.

> Врачам особо не надо ЛОР читать

психиаторам и психологам я думаю тут должно быть очень интересно

:) и не только психиатрам... Сам хирург, читаю ЛОР ежедневно..
По поводу DICOM. Нам рентгенологи дают результаты МРТ на дисках, там записана программа (eFilm кажется) и DICOM-файлы пациента. SI_Browser (и прочие вьюверы) открывает каждый срез по отдельности, но функионала eFilm явно не хватает ( удобная работа с различными проекциями, измерения и прочее). Из-за этого приходится гонять винду в Виртуалбоксе, т.к. в вайне eFilm не идёт...

ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2008/

РЕверси:)

>Не спрашивайте меня, откуда берутся закрытые форматы, и я не скажу >вам, как всё абсурдно в этом мире...

не пиши глупостей, если не знаешь, о чем идет речь. стандарт DICOM ни разу не закрытый.

>Stilleto: >Надо отметить что куча программ под linux умеет dicom, но не умеет метатэги его и не умеет его яркость выбирать (а dicom может быть с очень широким диапазоном) в итоге после конвертирования или на экране получаются серенькие картинки без дополнительной инфы которая была в dicom.

>alex046: >:) и не только психиатрам... Сам хирург, читаю ЛОР ежедневно.. По поводу DICOM. Нам рентгенологи дают результаты МРТ на дисках, там записана программа (eFilm кажется) и DICOM-файлы пациента. SI_Browser (и прочие вьюверы) открывает каждый срез по отдельности, но функионала eFilm явно не хватает ( удобная работа с различными проекциями, измерения и прочее). Из-за этого приходится гонять винду в Виртуалбоксе, т.к. в вайне eFilm не идёт...

Лично я для просмотра DICOMов использую ImageJ. Он умеет показывать теги, менять яркость и много чего еще. Для 3-хмерной реконструкции, работы с проекциями, etc использую MRIcro/MRIcron (последний вроде как поновее). Все три программы - opensource, отлично работают под Линукс.

PS. Работаю в лаборатории занимающейся исследованиями мозга при помощи fMRI (эх, нам бы таких пациентов как у вас тут на ЛОРе - это сколько диссертаций бы получилось ...), так что всё сказанное выше проверено на DICOMах MRI сканов головы. Насчет других машин и других частей тела не знаю - не пробовал. Ах, и да, по теме - посмотрел на SI_Browser. По-моему намного слабее чем ImageJ.

Я врач. К сожалению не слышал о этом формате и где его можно достать (эти файлы). Сейчас покачаем...

> Я врач. К сожалению не слышал о этом формате

Пипец! Только врачей, особенно психиатров, не хватало в комьюнити.

Однако это ж какой переворот. У меня начинает складываться впечатление, или может это на самом деле так... В Linux приходят серьезные специалисты (профессии). Это вам не вантузятня, с одними школьниками эникейщиками, не способными объяснить соседу, при установке венды ему на компьютер, зачем она вообще нужна.

чем больше будет программ для Linux для людей, чьи профессии не связаны с IT, тем лучше. разве нет?

> чем больше будет программ для Linux для людей, чьи профессии не связаны с IT, тем лучше. разве нет?

Это я как раз и хотел сказать. Windows-mainstream: это эникейщики да геймеры (очень правильное слово), а Linux-mainstream: это профессионалы, которым некогда бороться с программульками, им дело делать надо.

Microsoft сделала ставку на убогих. И теперь пожинает плоды, которые мы видим невооруженным глазом. Не дай бог OSS пойти тем же путем, лоб расшибет. Даешь программы для не-IT сферы.

Эээ... :) Я вот вобщем и есть наверное первый представитель медицинской IT (ГлавНИВЦ где я работаю преимущественно работает с больницами и поликлиниками). Программа есть и хорошо. Толку для популяризации linux в Российской Медицине - 0!.

В медицине дело не в том что есть относительно софт ввиде вьюеров и прочего, а в том что СЕРТИФИЦИРОВАННОГО нету. Сейчас скрипя зубами готовим сервера под масдай для системы работы с мед-данными от агафы (немецкая фирма). Спрашивали почему а линь не пишут сервер и клиент - заявили что нафиг оно им это нужно, путь будет на ведре и точка. А хотели OpenVista предложить но никто его не примет из-за отсутсвия сертификации... Обидно... :(

Осталось только найти второго Марка, чтоб деньги предложить за сертификацию. Мелкомягкие, я так подозреваю, уже сделали капиталовложения.

Смешно, но, наш чиновник, даже при идеальности системы для поставленной задачи, будет руководствоваться исключительно размером суммы наличной у сертифицируемого.

А слабо написать статейку про этих товарищей (из агафы), с описанием их высказываний и вашего мнения. Народ должен знать своих героев.

А чем моя профессия не устраивает? И причем тут венда? М\у прочим я уже года два как забыл что это такое. (ArchLinux - my best friend!)

> Linux-mainstream: это профессионалы, которым некогда бороться с программульками, им дело делать надо.

Так было раньше. Году так в 2000, сейчас линукс-мейнстрим, покрайней мере в россии - школие с завышеным чсв

Есть такие программы-) Мы поставляем с рентгеновскими аппаратами. Написано всё на java в Eclipse, всё кроссплатформенное. Разработка ведется под линуксом, но на рабочих местах докторов и лаборантов венда. Смысла открывать такой софт особо нет, нахрена он нужен без аппарата?

ещё один велосипед, да ещё и на паскале (!)
один из наиболее полных списков открытых
програм, вьюеров, библиотек по работе с DICOM 
здесь http://www.idoimaging.com/index.shtml
++ куча "неучтённого" софта 
полно проприетарного софта (типа, махаон, MedXpress, 
вьюер от MultiVox и тд. и тп.) 

> Мы поставляем с рентгеновскими аппаратами
"узнаю брата Колю"  :) - это не от "рентгенпрома"