Лучший Markdown для генерации статических сайтов типа .md на гитхабе.

hakyll

есть решение на языке go, hugo

http://spf13.com/project/hugo/

Jekyll https://jekyllrb.com/ и можно на github pages захоститься, github поддерживает Jekyll 3

А что значит «github поддерживает Jekyll», если везде один и тот же Markdown?

В смысле, что гитхаб может сам генератор запускать, не нужно устанавливать на рабочую станцию jekyll и все его зависимости. Просто пушишь свои текстовые файлы в репозиторий, а гитхаб запускает jekyll и публикует изменения.

About GitHub Pages and Jekyll

Jekyll's simplified build process with GitHub Pages is one of the biggest advantages of using Jekyll instead of other static site generators. GitHub Pages manages your site's build process with a single push to your site's publishing branch.

А при чём тут сам Jekyll? Ты пушишь Markdown-файлы, а каким средством GitHub их рендерит и публикует — Jekyll-ом или другой Markdown -> HTML фигнёй?

Jekyll - это не рендер Markdown-файлов.

А я таки просил рендер Markdown-файлов.

если везде один и тот же Markdown?

Гм, он везде разный. См. commonmark.

Посоветуйте тогда наиболее хороший markdown-генератор под linux.

А я таки просил рендер Markdown-файлов.

Я не понял что ты просишь — генератор или рендер и вообще кто такие генератор и рендер в применении к маркдауну.

Для конвертации маркдауна в хтмл я пользовал multimarkdown, потом перешёл на pandoc.

А что рулит сейчас? Меня интересует какое-то устоявшееся, распространённое решение на эту тему, которому уже некуда меняться и некуда устаревать, некий де-факто стандарт.

Стандарта нет, каждая реализация вносит свои расширения, кроме того, часто бывает что разные реализации интерпретируют сложные случаи по-разному (из-за того что стандарта нет а груберовский спек очень поверхностный). Есть попытка «достичь консенсуса», см. CommonMark.