Есть 64-битная джесси, в которой есть несколько i386-х библиотек
Используемый локальный реп (йоу!) на диске только 64-битный, 32-битного нет.
Удалить архитектуру, пока есть библиотеки - я не могу.
Отсюда проблема - при любом обновлении оно будет искать не только 64-битные библиотеки, но и 32-битные.
Нужно решение:
1. или как-то разнести 32 и 64 битные репы в sources.list
2. или как-то запретить обновлять 32-битные индексы Packages
3. или как-то удалить архитектуру, наплевав на имеющиеся пакеты (пусть болтаются в «Неизвестные или устаревшие пакеты»)