Я для своего круглосуточного вампира использую btpd, BitTorrent Protocol Daemon. Разок запустил, дальше он сам в фоне сидит и посасывает. Управление через интерфейс командной строки (не консольный, а именно командной строки).
P.S. пользую ctorrent, но лично мне оно надо от силы раз месяц, так что у меня основной критерий - простота и непритязательность (в частности по возможности безгуёвость).