Судя по всему, по крайней мере на чипсетах 350/370 (единственные доступные на данный момент для Ryzen) прийдется использовать ACS-патч, от использования которого пользователи AMD были освобождены до сего времени.
YouTube: Ryzen: PCIe Passthrough Working, But...*
https://level1techs.com/video/ryzen-iommu-pcie-passthrough-works