LINUX.ORG.RU
ФорумTalks

К вопросу о молекулярной сборке


0

1

http://it.siteua.org/ИТ-Новости/285070/Теперь_в_живых_организмах_могут_быть_н...
http://www.techeye.net/science/life-can-be-created-from-a-four-letter-word
19 Feb 2010

все живые формы на планете имеют собственные ДНК, состоящие из «букв» генетического кода,
каждая «буква» представляет собой нуклеотид.

http://ru.wikipedia.org/wiki/Дезоксирибонуклеиновая_кислота

С химической точки зрения ДНК — это длинная полимерная молекула,
состоящая из повторяющихся блоков — нуклеотидов.

http://ru.wikipedia.org/wiki/Нуклеотиды
http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotide

Каждый нуклеотид состоит из азотистого основания, сахара (дезоксирибозы) и фосфатной группы.
В ДНК встречается четыре вида азотистых оснований (аденин, гуанин, тимин и цитозин).
Азотистые основания одной из цепей соединены с азотистыми основаниями другой цепи
водородными связями согласно принципу комплементарности: аденин соединяется только с тимином,
гуанин — только с цитозином.
принимают участие в биосинтезе белков (процессе трансляции).

---

http://ru.wikipedia.org/wiki/Белок

Белки́ (протеи́ны, полипепти́ды[1]) — высокомолекулярные органические вещества,
состоящие из соединённых в цепочку пептидной связью альфа-аминокислот.

http://ru.wikipedia.org/wiki/Аминокислоты

В процессе биосинтеза белка в полипептидную цепь включаются 20 α-аминокислот,
кодируемых генетическим кодом. Помимо этих аминокислот, называемых протеиногенными,
или стандартными, в некоторых белках присутствуют специфические нестандартные аминокислоты,
возникающие из стандартных в процессе посттрансляционных модификаций.
В последнее время к протеиногенным аминокислотам иногда причисляют трансляционно
включаемые селеноцистеин (Sec, U) и пирролизин (Pyl, O).
Это так называемые 21-ая и 22-ая аминокислоты.

---

Трансляцией называют осуществляемый рибосомой синтез белка из аминокислот
на матрице информационной (или матричной) РНК (иРНК или мРНК).

В генетических кодах, использованных организмами до сих пор могло присутствовать до 64
возможных тройных комбинаций в четырех нуклеотидах (А,Г,Ц,Т => 4^3 = 64).
Каждое такое генетическое «слово» называется кодон.

http://ru.wikipedia.org/wiki/Кодон

Кодо́н (кодирующий тринуклеотид) — единица генетического кода,
тройка нуклеотидных остатков (триплет) в ДНК или РНК,
обычно кодирующих включение одной аминокислоты.
Каждый кодон кодируется либо для аминокислот,
либо он сообщает клеткам о необходимости производства того или иного протеина.

Последовательность кодонов в гене определяет последовательность аминокислот
в полипептидной цепи белка, кодируемого этим геном.

---

исследователи из Кембриджа создали биологический механизм,
кодирующий генетический код в четверных кодонах.

Таким образом, в новых ДНК, состоящих из четверных кодонов, в каждом кодоне присутствует по одному «лишнему» нуклеотиду,
тем не менее, все новые ДНК транслируются по тому же принципу, что и обычные.

Джейран Чин (Jason Chin)
http://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/group-leaders/a-to-g/j-chin

Chin has worked out a way of redesigning the cell's machinery
so that it can also read the genetic code four letters at a time.

За счет того, что ученые создали 256 возможных четырехбуквенных кодонов,
в клетках можно начать производство несуществующих в природе протеинов.

This boosts the number of amino acids that can be built into a protein from the 20
covered by the existing genetic code to 276.

Ответ на: комментарий от stevejobs

Что 256 - это очень годная цифра для кодирования всякой информации и вшивания ее в таком виде в разные клетки

StrongDollar
() автор топика
Ответ на: комментарий от StrongDollar

Простыню из википедии зачем вывалил? Кстати, с разморозкой, уже собрали полностью синтетическую бактерию, выгрузили ДНК, исправили, собрали ДНК, внедрили, получили организмы полностью с другой ДНК (т.е. потенциально уже можно программить)

Sadler ★★★
()
Ответ на: комментарий от Sadler

> потенциально уже можно программить

вот я и думаю - размер ДНК сравним с размером CD-диска, можно брать генту LiveCD и писать вирусы

StrongDollar
() автор топика
Ответ на: комментарий от StrongDollar

Вот только на перепрограммирование всего одной бактерии они убили года 3 по-моему. Если бы сборка цепочек ДНК была простой, проблем бы не было. И, кстати, увеличение числа кодонов вовсе не обязательно. Мы можем выращивать сколь угодно длинные протеины, просто не выставляя стоп-кодоны.

Sadler ★★★
()
Ответ на: комментарий от sin_a

> И что будет делать вирус, в который записан livecd?

Компилять генту прямо в мозг!

Sadler ★★★
()

>За счет того, что ученые создали 256 возможных четырехбуквенных кодонов,

в клетках можно начать производство несуществующих в природе протеинов.

Не факт, совсем не факт. Там всю систему перехерачивать придется. Рибосомы очень консервативные штуки и менять не похерив систему их очень сложно.

Аминокислот кстати больше 20, есть например селеноцистеин, селенметеонин, таурин. Они кодируются в ДНК но не трехбуквенным кодом а более древней системой где значение код зависит от контекста. Трехбуквенный код уже более новое изобретение. Так что скорее они просто откатились на шаг назад.

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от Sadler

>Вот только на перепрограммирование всего одной бактерии они убили года 3 по-моему.

Это очень быстро

Если бы сборка цепочек ДНК была простой, проблем бы не было.

Работа конечно трудоемкая но уже давно рутинная. А вот рациональный дизайн белков та еще алхимия

ы можем выращивать сколь угодно длинные протеины, просто не выставляя стоп-кодоны.

есть такая штука как преждевременный обрыв трансляции

DNA_Seq ★★☆☆☆
()
Ответ на: комментарий от StrongDollar

>256 - это очень годная цифра

4.2.

256 — это не цифра, это аж 3 цифры, из которых сложено число.

gentoo_root ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Sadler

>Вот только на перепрограммирование всего одной бактерии они убили года 3 по-моему.

Бактерии столько не живут.

gentoo_root ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от Sadler

>А почему она должна была жить в тот момент, когда собирали ДНК?

Ну не знаю. Мой компьютер включён, когда я собираю ему Генту, например. С бактериями не так? Или их собирают в чруте в другом месте?

gentoo_root ★★★★★
()
Ответ на: комментарий от gentoo_root

> Или их собирают в чруте в другом месте?

Именно так. Собирается ДНК, потом из этого ДНК получают новое потомство.

Sadler ★★★
()

В своём кратком курсе молекулярной биологии вызабыли про одно очень важное свойство генетического кода: вырожденность.

Axon ★★★★★
()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.